| 121. | parsimony | štedljivost primjena minimalnog broja koraka za postizanje cilja |
| 122. | pattern | uzorak opis kratkog slijeda nekog motiva; sastoji se od znakova za aminokiseline |
| 123. | PDB | (Protein DataBank) – zbirka svih javno dostupnih struktura makromolekula (kao datoteka koordinata atoma) određene kristalografijom ili nuklearnom magnetskom rezonancijom; pohranjena je na adresi www.rcsb.org |
| 124. | Perl | (Practical Extraction and Report Language) – skriptorski programski jezik opće namjene često korišten u bioinformatici |
| 125. | PHYLIP | programski paket za filogenetiku |
| 126. | phylogenetic tree | filogenetsko stablo genealoško stablo koje se izrađuje pomoću podatka dobivenih usporedbom slijeda aminokiselina u proteinu iz različitih vrsta |
| 127. | phylogenetics | filogenetika proučavanje evolucijskih odnosa među organizmima |
| 128. | phylogeny | filogenija evolucijska povijest taksonomskih skupina (razreda, porodica, rodova) |
| 129. | phylogram | filogram dijagram (stablo) koje procijenjuje filogeniju; duljina ogranaka je proporcionalna količini evolucijskih promjena |
| 130. | polyphyletic | polifiletski ono što ima podrijetlo iz više filogenetskih praoblika |
| 131. | polytomy | politomija u kladistici se odnosi na čvor s više od dvije grane potomaka |
| 132. | primary database | primarna baza podataka baza podataka koja sadrži podatke izravno prikupljene iz pokusa, npr. sljedove DNA ili proteina |
| 133. | profile | linearni model koji predstavlja karakteristike grupe sljedova |
| 134. | PubMed | javno sučelje za bazu podataka medicinske literature (MEDLINE) |
| 135. | quartet puzzling | heuristička metoda utemeljena na analizi kvarteta sljedova; izrađuju se najbolje četveročlano stablo za sve moguće kombinacije u nekom skupu podataka |
| 136. | query | upit korisnikov zahtjev za predočivanje informacije bazi podataka ili programu za pretraživanje |
| 137. | RASMOL | programski paket za prikaz proteinskih struktura |
| 138. | Ramachandran plot | graf koji prikazuje dozvoljene kutove rotacije kemijskih veza prostorne strukture (uglavnom proteina) |
| 139. | redundancy | zalihost ponavljanje više identičnih stavki; ako se količina informacije u sustavu ne mijenja dodavanjem podataka, kažemo da se zalihost u sustavu povećala; u bioinformati… Syn: redundancija |
| 140. | regular expression | pravilni izraz niz znakova koji opisuje uzorak; obično sadrži znakove za skraćivanje (wildcards) i varijabilna mjesta |
Pojmovnik 
